Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gabra6P16305 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gabra6P16305 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gabra6P16305 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra6P16305 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra6P16305 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra6P16305 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra6P16305 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra6P16305 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra6P16305 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra6P16305 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra6P16305 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra6P16305 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Gabra6P16305 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Gabra6P16305 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra6P16305 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra6P16305 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra6P16305 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra6P16305 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra6P16305 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra6P16305 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra6P16305 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra6P16305 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra6P16305 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra6P16305 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra6P16305 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra6P16305 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra6P16305 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra6P16305 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gabra6P16305 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Gabra6P16305 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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