Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CatspereP0DP43 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CatspereP0DP43 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms