Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SlkO54988 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SlkO54988 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SlkO54988 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SlkO54988 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SlkO54988 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SlkO54988 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SlkO54988 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SlkO54988 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SlkO54988 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SlkO54988 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SlkO54988 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SlkO54988 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SlkO54988 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SlkO54988 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SlkO54988 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SlkO54988 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SlkO54988 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SlkO54988 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SlkO54988 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SlkO54988 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SlkO54988 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SlkO54988 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SlkO54988 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SlkO54988 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SlkO54988 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SlkO54988 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SlkO54988 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SlkO54988 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SlkO54988 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SlkO54988 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SlkO54988 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SlkO54988 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SlkO54988 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SlkO54988 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SlkO54988 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SlkO54988 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SlkO54988 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SlkO54988 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SlkO54988 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SlkO54988 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlkO54988 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlkO54988 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlkO54988 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlkO54988 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlkO54988 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SlkO54988 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlkO54988 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlkO54988 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlkO54988 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlkO54988 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlkO54988 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlkO54988 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlkO54988 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlkO54988 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlkO54988 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlkO54988 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SlkO54988 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SlkO54988 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlkO54988 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlkO54988 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlkO54988 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlkO54988 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlkO54988 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SlkO54988 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SlkO54988 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlkO54988 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlkO54988 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlkO54988 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlkO54988 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SlkO54988 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlkO54988 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlkO54988 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlkO54988 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlkO54988 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlkO54988 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlkO54988 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlkO54988 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlkO54988 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SlkO54988 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SlkO54988 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlkO54988 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SlkO54988 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlkO54988 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlkO54988 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlkO54988 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlkO54988 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlkO54988 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlkO54988 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlkO54988 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SlkO54988 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SlkO54988 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlkO54988 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SlkO54988 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SlkO54988 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SlkO54988 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlkO54988 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlkO54988 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlkO54988 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlkO54988 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms