Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cited2O35740 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cited2O35740 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms