Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sema3aO08665 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms