Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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BC024978J3QPC3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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BC024978J3QPC3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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BC024978J3QPC3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BC024978J3QPC3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BC024978J3QPC3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BC024978J3QPC3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
BC024978J3QPC3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BC024978J3QPC3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BC024978J3QPC3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BC024978J3QPC3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BC024978J3QPC3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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BC024978J3QPC3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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BC024978J3QPC3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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BC024978J3QPC3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC024978J3QPC3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC024978J3QPC3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC024978J3QPC3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC024978J3QPC3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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BC024978J3QPC3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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BC024978J3QPC3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
BC024978J3QPC3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC024978J3QPC3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC024978J3QPC3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC024978J3QPC3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC024978J3QPC3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC024978J3QPC3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC024978J3QPC3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC024978J3QPC3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC024978J3QPC3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC024978J3QPC3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC024978J3QPC3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC024978J3QPC3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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BC024978J3QPC3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC024978J3QPC3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC024978J3QPC3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC024978J3QPC3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC024978J3QPC3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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BC024978J3QPC3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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