Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4V7

Gm17727, Predicted gene, 17727, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17727E9Q4V7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17727E9Q4V7 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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