Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsf1E9PWW9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms