Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms