Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6685D3YYP3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms