Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms