Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd3Q9Z2D8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms