Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms