Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB05

Napa, Alpha-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapaQ9DB05 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NapaQ9DB05 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms