Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V1

Sh2d4a, SH2 domain-containing protein 4A, mousemouse

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d4aQ9D7V1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d4aQ9D7V1 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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