Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V4

Taf1d, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1dQ9D4V4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf1dQ9D4V4 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms