Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Susd3Q9D176 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms