Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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Snx7Q9CY18 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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Snx7Q9CY18 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Snx7Q9CY18 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx7Q9CY18 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms