Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MINDY3Q9CV28 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms