Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms