Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Atp1b4Q99ME6 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms