Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3W7

Agr3, Anterior gradient protein 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Agr3Q8R3W7 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Agr3Q8R3W7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Agr3Q8R3W7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Agr3Q8R3W7 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Agr3Q8R3W7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Agr3Q8R3W7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Agr3Q8R3W7 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Agr3Q8R3W7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Agr3Q8R3W7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Agr3Q8R3W7 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Agr3Q8R3W7 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Agr3Q8R3W7 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Agr3Q8R3W7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Agr3Q8R3W7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Agr3Q8R3W7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Agr3Q8R3W7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Agr3Q8R3W7 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Agr3Q8R3W7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Agr3Q8R3W7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms