Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atg4aQ8C9S8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Atg4aQ8C9S8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Atg4aQ8C9S8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Atg4aQ8C9S8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Atg4aQ8C9S8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Atg4aQ8C9S8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Atg4aQ8C9S8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Atg4aQ8C9S8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Atg4aQ8C9S8 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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