Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem39bQ810L4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem39bQ810L4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms