Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trak1Q6PD31 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms