Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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Zbtb40Q6PCS8 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Zbtb40Q6PCS8 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Zbtb40Q6PCS8 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Zbtb40Q6PCS8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Zbtb40Q6PCS8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Zbtb40Q6PCS8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Zbtb40Q6PCS8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms