Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Neurod1Q60867 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Neurod1Q60867 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Neurod1Q60867 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Neurod1Q60867 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Neurod1Q60867 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Neurod1Q60867 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Neurod1Q60867 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Neurod1Q60867 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Neurod1Q60867 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Neurod1Q60867 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Neurod1Q60867 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Neurod1Q60867 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Neurod1Q60867 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Neurod1Q60867 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Neurod1Q60867 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Neurod1Q60867 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Neurod1Q60867 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Neurod1Q60867 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Neurod1Q60867 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms