Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SkiQ60698 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SkiQ60698 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SkiQ60698 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SkiQ60698 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SkiQ60698 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SkiQ60698 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SkiQ60698 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SkiQ60698 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SkiQ60698 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SkiQ60698 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SkiQ60698 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SkiQ60698 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SkiQ60698 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SkiQ60698 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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