Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Trp53i11Q4QQM4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Trp53i11Q4QQM4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Trp53i11Q4QQM4 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Trp53i11Q4QQM4 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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Trp53i11Q4QQM4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Trp53i11Q4QQM4 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Trp53i11Q4QQM4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Trp53i11Q4QQM4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Trp53i11Q4QQM4 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Trp53i11Q4QQM4 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Trp53i11Q4QQM4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Trp53i11Q4QQM4 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Trp53i11Q4QQM4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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