Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Tspan2-202ENSMUST00000119902 961 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Gm16540-201ENSMUST00000160263 426 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 2410021H03Rik-201ENSMUST00000187090 764 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Gm37978-201ENSMUST00000194736 2915 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Gm44417-201ENSMUST00000203298 3359 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Prpf18-201ENSMUST00000035721 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Cdkn1b-202ENSMUST00000067327 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Slc17a1-202ENSMUST00000110413 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Cabs1-201ENSMUST00000008051 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 AC167565.2-201ENSMUST00000227042 1870 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Gpr68-203ENSMUST00000110066 3223 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Psma2-201ENSMUST00000170836 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Gm12695-201ENSMUST00000107071 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Gm4894-202ENSMUST00000216428 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Ptpn5-202ENSMUST00000102626 3137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Olfr1232-203ENSMUST00000215679 2389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Slc37a2-202ENSMUST00000161114 2945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Gm16204-201ENSMUST00000117864 1897 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Gm10538-201ENSMUST00000189499 1877 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Zfp114-201ENSMUST00000086010 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Oprl1-201ENSMUST00000071585 2999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Gm35392-201ENSMUST00000209934 2121 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
SvipQ3UZP4 Gm36638-202ENSMUST00000192073 2169 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms