Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms