Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28047Q3US59 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28047Q3US59 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms