Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TraddQ3U0V2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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