Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
NrepQ07475 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
NrepQ07475 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NrepQ07475 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
NrepQ07475 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms