Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sox13Q04891 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sox13Q04891 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sox13Q04891 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sox13Q04891 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sox13Q04891 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sox13Q04891 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sox13Q04891 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sox13Q04891 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sox13Q04891 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sox13Q04891 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sox13Q04891 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sox13Q04891 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sox13Q04891 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sox13Q04891 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sox13Q04891 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sox13Q04891 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sox13Q04891 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sox13Q04891 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sox13Q04891 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sox13Q04891 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sox13Q04891 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sox13Q04891 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sox13Q04891 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sox13Q04891 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sox13Q04891 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sox13Q04891 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sox13Q04891 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sox13Q04891 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sox13Q04891 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sox13Q04891 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sox13Q04891 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sox13Q04891 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sox13Q04891 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sox13Q04891 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sox13Q04891 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms