Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Msx2Q03358 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Msx2Q03358 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Msx2Q03358 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Msx2Q03358 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Msx2Q03358 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Msx2Q03358 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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