Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms