Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb1P70662 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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