Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cacnb3P54285 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cacnb3P54285 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cacnb3P54285 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacnb3P54285 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacnb3P54285 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacnb3P54285 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacnb3P54285 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacnb3P54285 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacnb3P54285 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacnb3P54285 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacnb3P54285 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms