Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PctpP53808 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PctpP53808 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PctpP53808 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PctpP53808 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PctpP53808 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PctpP53808 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PctpP53808 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PctpP53808 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PctpP53808 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PctpP53808 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PctpP53808 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PctpP53808 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PctpP53808 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PctpP53808 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PctpP53808 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PctpP53808 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PctpP53808 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PctpP53808 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PctpP53808 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PctpP53808 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PctpP53808 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PctpP53808 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PctpP53808 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PctpP53808 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PctpP53808 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PctpP53808 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PctpP53808 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PctpP53808 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PctpP53808 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PctpP53808 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PctpP53808 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PctpP53808 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PctpP53808 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PctpP53808 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PctpP53808 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PctpP53808 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PctpP53808 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PctpP53808 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PctpP53808 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PctpP53808 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PctpP53808 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PctpP53808 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PctpP53808 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PctpP53808 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PctpP53808 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PctpP53808 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PctpP53808 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PctpP53808 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PctpP53808 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PctpP53808 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PctpP53808 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PctpP53808 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PctpP53808 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PctpP53808 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PctpP53808 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PctpP53808 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PctpP53808 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PctpP53808 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PctpP53808 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PctpP53808 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PctpP53808 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PctpP53808 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PctpP53808 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PctpP53808 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PctpP53808 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PctpP53808 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PctpP53808 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PctpP53808 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PctpP53808 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PctpP53808 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PctpP53808 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PctpP53808 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PctpP53808 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PctpP53808 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PctpP53808 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PctpP53808 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PctpP53808 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PctpP53808 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PctpP53808 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PctpP53808 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PctpP53808 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PctpP53808 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PctpP53808 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PctpP53808 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PctpP53808 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PctpP53808 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PctpP53808 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PctpP53808 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PctpP53808 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PctpP53808 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PctpP53808 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PctpP53808 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PctpP53808 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PctpP53808 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PctpP53808 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PctpP53808 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PctpP53808 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PctpP53808 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PctpP53808 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms