Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms