Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxraP28700 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxraP28700 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxraP28700 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxraP28700 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RxraP28700 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxraP28700 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxraP28700 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxraP28700 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RxraP28700 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RxraP28700 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxraP28700 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RxraP28700 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxraP28700 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxraP28700 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxraP28700 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxraP28700 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxraP28700 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RxraP28700 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxraP28700 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxraP28700 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxraP28700 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxraP28700 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxraP28700 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxraP28700 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxraP28700 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxraP28700 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxraP28700 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxraP28700 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RxraP28700 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxraP28700 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxraP28700 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxraP28700 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxraP28700 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxraP28700 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxraP28700 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxraP28700 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxraP28700 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxraP28700 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxraP28700 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxraP28700 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxraP28700 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxraP28700 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxraP28700 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RxraP28700 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxraP28700 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxraP28700 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RxraP28700 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxraP28700 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RxraP28700 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxraP28700 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxraP28700 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxraP28700 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxraP28700 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxraP28700 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RxraP28700 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxraP28700 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxraP28700 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxraP28700 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RxraP28700 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxraP28700 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxraP28700 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxraP28700 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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