Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

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Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms