Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa1P11477 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa1P11477 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa1P11477 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa1P11477 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa1P11477 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa1P11477 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa1P11477 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa1P11477 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa1P11477 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa1P11477 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms