Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms