Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BC067074F6RXI4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms