Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms