Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc170D3YXL0 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms