Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdpk1Q9Z2A0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdpk1Q9Z2A0 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdpk1Q9Z2A0 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdpk1Q9Z2A0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdpk1Q9Z2A0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pdpk1Q9Z2A0 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pdpk1Q9Z2A0 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pdpk1Q9Z2A0 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pdpk1Q9Z2A0 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pdpk1Q9Z2A0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pdpk1Q9Z2A0 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pdpk1Q9Z2A0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms