Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms